3-2 全長轉█錄組測序Iso-Seq-標題圖

全長轉◥錄組測序(Iso-Seq)是基於PacBio單分子實時測序技術,憑借超長『讀長的優勢,無需打斷RNA分子,直接對反轉錄的全長cDNA測序,即可得到從5’末端到3’PolyA尾的高質量海南七星彩局王奖表全長轉錄本序列,從而對同源異構體(isoform)、可變剪接、融合基因、同源基因、超家族基因、等位基因表達等進行精確分海南七星彩2213期头尾析。

小標題-產品優勢-中
超長讀長直接測序即可獲得完整的全長轉錄組序列信息;
有效繪制復雜基因組特区彩票论坛 海南七星彩的轉錄圖譜,作為基因功能研究的參考序列;
能準確鑒定同源異構體、可變剪切和融合基因ㄨ等。

小標題-技術路線-中

3-2 全々長轉錄組測序№Iso-Seq-信息分析-有參-附圖-小

PacBio有參全長轉錄組信息分析≡流程

3-2 全長轉海南七星彩大精英版錄組測序Iso-Seq-信息分析-無參-附圖-小

PacBio無參全長轉錄組信息分析流海南七星彩高手论沄程

小標題-樣品要求-中

圖標-NGS紫-樣品-小

Total RNA

總量≥2μg,濃度≥300?ng/μl;

RIN值≥8.5;

無DNA及蛋白質汙染,無降解

圖標-NGS紫-文庫-小

文庫

1~4Kb,4~10Kb

圖標-NGS紫-測序-小

策略

測序平臺:PacBio Sequel

測序深度:4~8 Gb/樣本

小標題-案例分析-中

PacBio?Iso-seq揭示玉米轉錄組海南七星彩解梦号码的復雜性

冷泉港實驗室◥的研究人員選取6種不同的玉米組織進行全長轉錄組海南七星彩1474期规律測序查海南七星彩今晚开奖,在進行信息分析過程中,與參←考基因組B73 RefGen_v3比對註釋,進】行了新的isoform鑒定,發現了大量新基因和新的轉錄異構體;進一步對不同組織進行差異▲分析,鑒定出組織特異性南国海南七星彩图规的可變剪接分析、IncRNA分析與鑒定、isoform鑒定分析。

在具體的研究過程中,作者選取玉米(Inbred line B73)不同發育階段的6個組織,包括根、花粉、胚、胚乳、幼穗和幼雄穗。采用Pacbio RS Ⅱ平臺的Iso-Seq策略,共發現了111151個isoform,對應於27000個基因,幾乎是參考基因組中轉錄本南国网海南七星彩图规數目的一倍。進一步研究發最新海南七星彩长条現3%的isoform代表了新位點的新轉錄本,而57%是新的isoform,與帶註釋的參□考基因至少有一個共同的剪接位海南七星彩走势图规點。之後研究人員采用Illumina HiSeq 2000平臺PE101測序重↓復樣本的RNA,以便驗海南七星彩1482證和量化PacBio產生168图库联盟海南七星彩加急图片的轉錄本isoform。對比PacBio數據,6種組織中平均86%的剪接點獲得短讀長測序的支持。此外,不同玉米組織內的可變剪接類型、lncRNA種類和數量存在顯※著的差異,而高■水平的CHG甲基化可能Ψ會抑制可變剪接發生,長片段的轉錄々組數據也有助於修復不正確的基因〓模型。

3-2 全海南七星彩1352期長轉錄組測序Iso-Seq-案例分析-附圖-小

Pacbio測序結果與〓RefGen_v3註釋結果對比

Bo Wang, Elizabeth Tseng, Doreen Ware., Unveiling the complexity of the maize transcriptome by single-molecule long-read sequencing. Nature Communications.2016,7:11708