BioNano Saphyr 輔助基海南七星彩走势图长条因組組裝-標題圖-小

BioNano光學圖譜系統基於單分子光學圖譜技術,通過其特有的芯片技術使完整的單一DNA分子可以在納米通道中平行排▼列,拍照成像,展示更完整的基因組圖譜。通過單〓分子光學圖譜,提供基因組宏觀的框架支◎持,保證拼接組︽裝結果的準確性和真實性。在重復︽序列區域,可以準確地確定重︾復片段拷貝數。通過Illumina或PacBio測序,結合BioNano圖譜進行Scaffolding,使組裝指標顯著提升。

小標題-產品優勢-中

可驗證測序組裝結〗果的準確性,對測序組裝片段進行排序和方向定位,並且識別測序組裝中潛在的錯誤組裝;
不需要將DNA分子打斷◤成短片段,也不進行海南七星彩开奖规律图擴增,最長讀長海南七星彩1433期论坛可達Mb級,真實地展示基因組信息;
可提高基因組組裝效果,大幅度↑提高scaffold N50的長度,減少scaffold的數量;
可評估相鄰序列片段之╲間的gap大小。

小標題-技術路線-中

4-1 輔助基因組組裝(BioNano)-組裝分析-附圖1

BioNano輔助基因組組裝分析←流程圖

小標題-樣品要求-中

圖標-NGS紫-樣品-小
哺乳動物:血液≥5ml
魚:血液≥300μl
植物:黃化苗≥2g

圖標-NGS紫-文庫-小

高質量DNA單分子文庫

圖標-NGS紫-測序-小
測序深度≥100X

小標題-案例分析-中

應用PacBio與BioNano對玉米基因組測序和組裝

冷泉港實驗室的研究人員利用單分子實時測序和高分辨率光學◆圖譜技術對玉米參考基〗因組進行組裝和註釋,可作為基因組學和農業功能性研究的↑基礎模型。
研究人員采¤集玉米近交品系B73, NCRPIS (PI550473),通過PacBio RSⅡ平臺,65X測序深度,組裝得到⌒了2958個Contig,ContigN50超過1.2Mb。PacBio測序結果彌補了之前版本⌒的大量gap,涵蓋了幾乎全部10條染色體的著絲粒和部分端粒序列。然♀後通過結合BioNano光學圖譜進行Scaffolding,獲得625個Scaffold。並通過Illumina HiSeq2500平臺,100X測序深度矯正三代組裝錯誤,提高測序準確度。相對於此前的參考基因組,本研究中組裝的Contig長度增加了52倍,並且在基因間區和著絲粒的組裝方面有了顯著的提升∞。

4-1 輔助基因組組裝(BioNano)-案例分析-附圖-小

利用光學基因組圖譜對著絲粒和端☉粒進行質量評估

Yinping Jiao, Paul Peluso, Jinghua Shi. An improved maize reference genome with single-molecule technologies. Nature. 2017 Jun 22. doi:10.1038/nature22971