10x Genomics輔助基因海南七星彩开奖规律表組組裝-標題圖

目前因受讀長的限制,單純使用Illumina測序系統已海南七星彩四定玩法經無法滿足日益發展的組裝、結構變異、多態性等研究的要求。而10x Genomics Chromium系統利用其獨有的液滴式文庫構建解碼技術,針對長片段序列進行等溫擴增並海南七星彩高手论坛引入了barcode序列編輯單條DNA分子,再i海南七星彩开奖结果查询連接測序接頭形成完整文庫並進行Illumina測序,此項技術通過帶有相同barcode標簽的reads進行組裝,計算得到跨度在□ 50-100Kb的linked-reads信息,從而獲得大片段的遺傳信息。這一技術彌海南七星彩开奖今晚補了二代測序平臺讀長短、無法獲取海南七星彩1425期長片段信息的短板,在全基因組測序和外顯子組測序領域具有重要的海南七星彩梦册查码蛇應用價值,尤其是在基海南七星彩梦图查询因組海南七星彩头尾网站海南七星彩头尾规律de novo組裝方面優勢明顯。

小標題-產品優勢-中
提升▃組裝參數:結合該技術的組裝效果較單獨使用Illumina數據最下载海南七星彩大精英版高可提升十幾倍;
測序平臺通用性海南七星彩开奖结杲 - 百度:應用該技術構建的文庫可與Illumina測序海南七星彩做梦码系統完美匹配;
分子片段長:分析可將短Reads組裝成長達50-100Kb的linked-reads;
單倍體分析:可實現染色體級別Phasing,獲得精確的單體型信海南七星彩开奖历史息。

小標題-技術路線-中
5-1 輔助基因組組裝(10x Genomics)-信息分析-附圖1

基於barcode技術的10x Genomics輔助基因組組裝流程

小標題-樣品要求-中

圖標-NGS紫-樣品-小
gDNA
片段要求:主帶﹥50kb

圖標-NGS紫-文庫-小
50kb~100kb插入片段

圖標-NGS紫-測序-小
Illumina PE150
測序深度≥100X

小標題-案例分析-中
應用10x Genomics輔助基因組組裝效果評估

目前對人類海南七星彩粤海局王基因組de novo測序和組裝的成功案例是將Illumina短片段測序、PacBio單分子實時測序技術、BioNano光學圖譜技術相結合,但這種海南七星彩票今天结果方法中PacBio的測序成本相對較高。
本研究提供了一種基因組de novo測序168图库联海南七星彩版和組裝的新方法。這種方法使用10x Genomics的linked-reads來獲得中長片段的海南七星彩投注软件數據,然後使用Illumina測序,結合BioNano構建基因組圖譜,對contigs進行anchoring和scaffolding,最終組裝的基海南七星彩开奖结果图因組Scaffold N50達33.5Mb。並通過對人海南七星彩规律论坛類HapMap樣品(NA12878)進海南七星彩上期开什么行基因組de novo組裝驗證了這種方法的可行性。
使用10x Genomics+Illumina+BioNano的方法進行基因組組裝的結果表明,scaffold N50長度和組裝的基因組長度均顯著提高,而scaffold的數目海南七星彩精选论坛顯著減少。

5-1 輔助基因組組裝(10x Genomics)-案例分析-附圖-小

Yulia Mostovoy, Michal Levy-Sakin, et al., A hybrid approach for de novo human genome?sequence assembly and phasing. Nature Methods. 2016 May 9. doi: 10.1038/NMETH.3865.